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客户文章集锦 | 转录-蛋白联合分析硕果累累

作者：上海中科新生命生物科技有限公司 2021-12-25T18:31 (访问量:2753)

生物学现象复杂多变，基因表达调控复杂，传统单一层面的组学研究比如基因组，转录组，蛋白组，代谢组等研究手段能够在一定程度上对特揭示遗传信息、蛋白功能或代谢通路进行阐释。但是，仅通过单一组学数据很难对复杂的生物网络调控进行更加系统性更全面的解释，不足以解释遗传信息表达调控的传递链条。

转录组学和蛋白质组学都是用来检测基因在不同分子层面的表达水平，有越来越多的科研工作者选择以转录组+蛋白质组联合的方式去研究基因表达调控机制。【中科新生命】自发布转录-蛋白联合分析产品以来，获得广大科研工作者的青睐，收获颇丰。下面就分享几篇转录-蛋白联合分析的客户文章，希望能帮助各位小伙伴们开启新的科研思路，助力新的发现~

01 转录-蛋白联合研究氧化锌暴露造成神经毒性的分子机制

文章名称：Intranasal exposure to ZnO nanoparticles induces alterations incholinergic neurotransmission in rat brain

发表期刊：《Nano Today》

合作单位：中国科学院生态环境研究中心

研究简介：

纳米技术的出现引发了从机器到药物的新型商业产品浪潮，带来了深远的社会和经济效益。与此同时，由于人类接触纳米粒子 (NPs) 的前所未有的途径，潜在的人类健康风险越来越引起人们的关注。全面了解 NPs 的毒性可以带来更安全的设计，并减少 NPs 的副作用或意外后果。研究表明吸入氧化锌纳米颗粒（NPs）会造成神经毒性，但其分子机制尚不清楚。本研究将大鼠分别暴露于氧化锌及硫酸锌，并通过影像学、转录-蛋白质多组学揭示了氧化锌暴露造成神经毒性的分子机制，为安全设计氧化锌纳米颗粒提供了依据。

联合分析展示：

转录-蛋白数据揭示胆碱能神经传递在氧化锌暴露神经毒性中起到重要作用

02 转录-蛋白多组学联合分析人参皂苷的抗癌活性

文章名称：20(S)-protopanaxatriol promotes the binding of P53 and DNA to regulate the antitumor network via multiomic analysis

发表期刊：《Acta Pharmaceutica Sinica B》

合作单位：南开大学

研究简介：

尽管已知肿瘤抑制因子 P53 可调节广泛的信号通路网络，但仍不清楚某些药物如何影响这些 P53 信号通路网络。人参皂苷是一种传统中药，人参的活性成分已被证明可有效治疗多种癌症疾病。然而，人参的传统用法往往涉及多种草药的多种成分，因此，人参的作用机制模糊不清，难以辨别。与宿主蛋白相互作用用于癌症治疗的特定人参皂苷成分仍然未知。在这项研究中，作者使用转录组和蛋白组等多组学分析揭示 P53 蛋白是影响人参皂苷抗肿瘤活性的潜在关键靶点。该结果不仅为验证靶蛋白和筛选复杂混合物的活性成分提供了新的策略，而且发现了促进P53与DNA相互作用的有力成分，推动了P53相关疾病的治疗。

联合分析展示：

转录-蛋白联合分析揭示人参皂苷的抗肿瘤活性与 P53 密切相关

03 转录组+蛋白质组联合助力生理分子机制研究

文章名称：Integrative transcriptome and proteome analyses provide new insights into different stages of Akebia trifoliata fruit cracking during ripening

发表期刊：《Biotechnol Biofuels》

合作单位：中国农业科学院麻类研究所

研究简介：

三叶木通是一种重要的油料经济作物。然而，在果实成熟的过程中往往会出现开裂的情况，从而更易造成病虫害导致减产。为了研究果实开裂的分子机制，研究团队采用了细胞器形态学观察、转录组学+蛋白质组学联合分析、靶向蛋白质组验证（PRM）的研究手段，发现：(1) 在开裂的果实中，它们的细胞壁会在前期变薄及更松散；(2) 转录+蛋白质组联合分析显示：细胞壁代谢相关基因，例如果胶裂解酶、果胶酯酶、β-半乳糖苷酶等在开裂果实中显著上调；本次研究成果为三叶木通的分子育种提供了有用的分子机制基础。

联合分析展示：

转录-蛋白鉴定参与果实破裂的潜在基因/蛋白质

04 转录组+蛋白组联合揭秘枇杷花的发育机制

文章名称：An Integrative Analysis of Transcriptome, Proteome and Hormones Reveals Key Dierentially Expressed Genes and Metabolic Pathways Involved in Flower Development in Loquat

发表期刊：《International Journal of Molecular Sciences》

合作单位：西南大学

研究简介：

枇杷是蔷薇科重要的热带和亚热带果树树种，其生殖发育是一个不受冬季休眠干扰的连续过程，几乎所有生长在枇杷树上的枝都是开花的枝，而圆锥花序的数量几乎每年保持不变。因此，研究枇杷花发育的调控机制有助于更好地了解蔷薇科植物的开花过程。本研究从花芽分化(FBD)、花芽伸长(FBE)和花开花(FA)三个方面，使用转录组和蛋白质组测序，通过对一些关键的DEGs、代谢途径和内源激素的分析，揭示了关键的开花基因和代谢途径。为进一步阐明枇杷和其他蔷薇科植物的花发育机制提供了丰富的序列资源。

联合分析展示：

转录-蛋白数据表明淀粉和蔗糖代谢相关基因在花发育过程中起着关键作用

05 转录-蛋白组学联合揭示坛紫菜抗逆机制

文章名称：Multi-omics responses of red algae Pyropia haitanensis to intertidal desiccation during low tides

发表期刊：《Algal Research》

合作单位：上海海洋大学

研究简介：

紫菜，因其独特的风味而在世界范围内广受欢迎。近年来，海水养殖场经常遇到被称为“温度回升”的异常天气，期间急剧升高和持续的高温（28～30℃）显著抑制了坛紫菜生长，导致其产量下降。因此，迫切需要建立坛紫菜分子育种体系以加快育种进程和效率，其中抗逆分子机制分析和抗逆基因筛选是关键步骤。在本研究中，使用转录组和蛋白质组分析确定叶状体对单重干燥胁迫 (SS) 和干燥、高温和强光三重胁迫 (TS) 的多组学响应。该研究结果为提高对全球变暖引起的非生物胁迫的抗性的品种的育种策略提供了宝贵的见解。

联合分析展示：

转录-蛋白数据揭示坛紫菜响应胁迫的分子机制

转录-蛋白强强联合

◆ 两组学数据信息互补，对生物体特定状态下的生理机制进行全方位解析；

◆ 分析同一基因转录水平和翻译水平的变化，全面挖掘关键基因表达调控机制；

◆ 转录组可以为蛋白组提供更完整的数据库，提高蛋白鉴定数目和质量。

转录-蛋白联合分析流程图

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