全转录组测序
真核生物转录组测序的研究对象为特定组织或细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括 mRNA、LncRNA和环状RNA 。
大片段测序（BAC)
BAC克隆等大片段DNA测序已在国内外全基因组测序和功能基因筛选中得到广泛应用，但因为涉及高质量的shotgun文库构建和大规模、高通量测序平台的建立，目前国内除参加过人类基因组计划的研究机构外，还鲜
利用转座酶研究染色质可接近性的高通量测序
ATAC-seq可以检测染色质开放区域，其原理是通过转座酶Tn5容易结合在开放染色质区域的特性，对Tn5酶捕获到的DNA序列进行测序和富集分析。
焦磷酸测序
焦磷酸测序技术服务基于QIAGEN公司PyroMark平台，能提供SNP基因分型、等位基因频率分析和甲基化检测等技术服务。具有定量准确、快速、多位点同时分析等特点，已成为DNA数据分析的金标准。
ChIP-Seq
ChIP-Seq采用特异抗体对目的蛋白进行免疫沉淀，对其进行纯化和文库构建，再通过高通量测序，在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA。